최근 들어 파일 삭제가 매우 느리게 진행됩니다.

gksrb500의 이미지

안녕하세요. 계산화학을 하는 대학원생입니다.

단순 노가다 작업이 필요할 때, 인터넷으로 배운 낮은 수준의 코딩으로 작업을 수행합니다.

그러다 최근 들어 rm -f 명령어에서 코드 진행이 안되는데 거의 1~2분에 하나 씩 삭제가 돼서 골치가 아픕니다.

top 명령어로 cpu load average을 알아봐도 0.28, 0.42, 0.36 수준으로 낮고, iostat에서 $idle 이 80%를 넘는 수준이고, ping 1.1.1.1 도 한 자릿수입니다.

파일 삭제가 빠르게 안되는데 또 어떤 것을 확인해봐야 하는지, 혹은 코드에서 문제가 있는지 궁금해서 여기에 질문을 올려봅니다.

#!/bin/bash
 
DIRECTION=~/Gaussian09/TMG
nodes="8"
files="ADD_NH3_GaCH3_2_NH2 ADD_NH3_GaCH3_NH2_2 ADD_NH3_TMG GaCH3_2_NH3 GaCH3_NH3_2 GaNH2_3"
Temp="298 373 573 773 973 1173 1373 1573"
 
for dd in $files
do
	cd ${DIRECTION}/${dd}
	rm -f hy.sh.e*
	rm -f hy.sh.o*
	for i in $Temp
	do
		rm -f ${dd}_${i}.gjf
		cp ${dd}.gjf ${dd}_${i}.gjf

rm 이 있는 부분만 따서 올렸습니다.

고수님들 잘부탁드립니다!

김정균의 이미지

흠.. 이 문제는 script layer 에서 해결을 할 수 있는 문제는 아닌 듯 싶은데요.
아마도 해당 디렉토리 구조에 파일이 굉장히 많이 있는 환경일 듯 싶습니다만..

아마도 저 위치에서 ls 만 하셔도 결과가 나오는데 굉장히 오래 걸리지 않나요?

혹시 ext4 filesystem 사용 중이라면, xfs 로 변경하면 약간(쥐꼬리만큼..) 더 좋아지기는 합니다만.. 너무 많은 파일리스트가 존재한다면.. 도찐개찐이기는 합니다.

cjh의 이미지

오래 걸리는 rm 이 있는 라인이 항상 동일 한가요 랜덤 한가요?

정균님 말씀 대로 파일이 무지 많거나 (df -i 로 확인 가능) 지우려는 파일이
무지하게 크거나 하면 rm 이 느릴 수 있습니다.

그리고

rm -f ${dd}_${i}.gjf
cp ${dd}.gjf ${dd}_${i}.gjf

는 아래와 같이 줄일 수 있겠네요.

cp -f ${dd}.gjf ${dd}_${i}.gjf

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