C#으로 어떤 프로그램을 cmd를 이용하여 명령어를 넣는데 redirect 명령어를 인식하지못합니다.

aiba002의 이미지

제목과 동일합니다.

현재 C#으로 command가 실행되는 프로그램을 실행시키는 작업을 하고 있습니다.
명령어가 예를 들어
a.txt b.txt > c.txt
이렇게 되면 a파일과 b파일을 합친 c파일이 출력 돼야합니다.

근데 이런저런 방법 많이 찾아봐도 ">" 이 redirect 명령어를 인식하지못하고 틀린 명령어라고 인식합니다.
그래서 redirect 명령어를 사용하지않고 파일 출력으로 빼는 방법도 해봤는데
희안하게 정상적으로 출력된 파일보다 파일 출력 량이 많게 출력이 됩니다.

혹시 파일 입출력 방식이 잘 못된건가 하여 소스도 일부 첨부합니다.

 
            Process compiler = new Process();
            compiler.StartInfo.FileName = "samtools.exe";
            compiler.StartInfo.Arguments = "view -bq 1 -t chr1.fa 2_bwa_mem.sam";
 
            compiler.StartInfo.UseShellExecute = false;
            compiler.StartInfo.RedirectStandardOutput = true;
            compiler.Start();
 
            string savePath = "E:/test/3_sam_view_ex.bam";
           File.WriteAllText(savePath, compiler.StandardOutput.ReadToEnd());
          compiler.WaitForExit();

이것때문에 계속 찾아보고 있는데 쉽지않네요.
무엇이라도 좋으니 힌트 주시면 감사하겠습니다.

mauri의 이미지

Process compiler = new Process();

compiler.StartInfo.FileName = System.Environment.GetEnvironmentVariable("ComSpec");
compiler.StartInfo.Arguments = "/c type d:\\test1.txt d:\\test2.txt > d:\\output.txt";

compiler.Start();
compiler.WaitForExit();
compiler.Close();

D드라이브에 test1.txt와 test2.txt를 놓고 해봤는데, 문제없이 잘 됐습니다.
혹시나 다른걸 필요로 하시는지요?

aiba002의 이미지

편의상 예제를 단순한 파일합치기처럼 들었는데 그게아니라,

여러 옵션값을 갖고 파일 결과를 출력해내는 프로그램이 위에서 실행되는 프로그램입니다.
그래서 그 프로그램의 출력결과를 갖고싶은것인데
">" 리다이렉트 명령어를 인식하지 못하더라구요.
그래서 그걸 그냥 받아 써볼까 하고 출력으로 받은 것인데 제대로 안받아지더라구요.

mauri의 이미지

죄송합니다. 질문내용을 잘 이해하지 못했네요.

compiler.StartInfo.FileName = System.Environment.GetEnvironmentVariable("ComSpec");
compiler.StartInfo.Arguments = "/c samtools.exe view -bq 1 -t chr1.fa 2_bwa_mem.sam > E://test//3_sam_view_ex.bam";

질문 내용에 있는 실행파일과 옵션을 지정한다 할 경우 위와 같이 해보시면 될듯 싶은데요?

실행시킬 실행파일을 바로 지정을 하셨는데요.
이 경우 리다이렉트 명령어는 "해당 실행파일"이 옵션으로 지원을 해줘야 합니다.

리다이렉트 명령어'>'는 어디까지나 콘솔 표준출력이 지원을 하는 것이지 콘솔모드로 실행가능한 모든 프로그램이 옵션으로 지원하는 것이 아니니까요..

콘솔을 실행시키고.. 해당 콘솔에서 samtools.exe를 실행.
samtools.exe의 실행 결과를 리다이렉트해서 3_sam_view_ex.bam에 출력..

이러한 순서가 됩니다.

내용추가)
참고로, "많게 출력된다"는 것이 혹시 몇바이트를 말씀하시는 거라면 WriteAllText(파일경로, 내용, Encoding.Default)를 추가해주시면 됩니다.

인코딩 설정을 하지 않으면 UTF-8로 저장되기 때문에 바이트수가 증가합니다.

aiba002의 이미지

보내주신 소스는 실행되지않고 꺼지길래
"리다이렉트 명령어'>'는 어디까지나 콘솔 표준출력이 지원을 하는 것이지 콘솔모드로 실행가능한 모든 프로그램이 옵션으로 지원하는 것이 아니니까요.."
이 말을 보고 찬찬히 다시 생각해보았습니다.

지금까지는 객체를 생성해서 직접 실행할 생각만했는데,
말씀 덕분에 cmd 실행을 하고 명령어 넣는 방식으로 방향을 바꿔서 생각하게됐습니다.

성공했습니다.!!!!! 정말 감사해요~
2달동안 헤매던게 저 한마디보고 해결할 수 있게되었네요.
다른 더 좋은 방법이 있을 수 있지만 현재는 제대로된 출력을 확인할 수 있다는게 너무 행복하네요.

새해 복 많이 받으세요~

            System.Diagnostics.Process process = new System.Diagnostics.Process();
            System.Diagnostics.ProcessStartInfo startInfo = new System.Diagnostics.ProcessStartInfo();
            startInfo.FileName = "CMD.exe";
            startInfo.WorkingDirectory = @"E:\";
 
            startInfo.UseShellExecute = false;
            startInfo.RedirectStandardInput = true;
            startInfo.RedirectStandardOutput = true;
            startInfo.RedirectStandardError = true;
 
            process.EnableRaisingEvents = false;
            process.StartInfo = startInfo;
            process.Start();    //프로세스 시작
            process.StandardInput.Write("samtools.exe view -bq 1 -t chr1.fa 2_bwa_mem.sam > 3_sam_view_0107.bam" + Environment.NewLine);  
            process.StandardInput.Close();

아 그리고 마지막에 추가의견 달아주신것은
default 값이 UTF-8이기때문에 같은 결과가 나오는 것으로 알고있습니다.

mauri의 이미지

조금이나마 도움이 되서 저도 기뻐요~ >_<)!
즐거운 주말 되세요.

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