윈도우에서 작성한 코드를 맥에서 컴파일하면 한글이 깨져버리는 현상..? 또는 그 반대...?

늘 답답하던 부분인데요
맥북 살때부터 '맥 터미널에서 vi편집기로 c 코딩 하면 참 좋겠다..' 이 생각을 쭉 해왔었어요
첫 날 한글로 소스코드를 짜니 다 깨져버려 당황도 했었지만
구글링해본 결과 홈 디렉토리의 .vimrc파일에 다음과 같이 추가하니 해결되더군요
set fenc=korea
set fencs=ubs-bom,utf-8,korea

그 이후로 맥 터미널에서 한글로 코딩도 되고
(illegal character encoding in string literal이라는 경고가 뜨긴 해도)
컴파일 해서 실행파일 돌려보면 한글이 제대로 출력은 되거든요

대부분의 사람들이 Windows OS를 더 많이 쓰기에 학교에선 어쩔 수 없이 윈도우에서 구현한 리눅스 터미널인 Cygwin을 사용해서
가끔은 어쩔 수 없이 학교 서버에서 Cygwin도 사용하는데요..

그런데 윈도우 컴퓨터끼리 소스코드를 주고받거나 맥끼리 소스코드를 주고 받는데는 전혀 문제가 없는데
윈도우 -> 맥, 맥 -> 윈도우로 파일 전송을 하면 컴파일 시 한글이 깨져버리네요;;

똑같은 gcc컴파일러로 컴파일하는데 왜 이런 일이 발생할까요?
물론 컴파일하면 Cygwin에서는 .exe파일로 맥 터미널에서는 .out파일로 확장자가 다른 실행파일이 생성되긴 한데 이 차이 때문에 실행파일에서 서로 한글이 깨져보이는걸까요?
소스코드에서 한글이 깨져보일 때는 인코딩을 잘 맞추면 해결이 되었지만
컴파일 후 실행파일에서 한글이 깨져보이는 문제는 막막하네요...;;

혹시 같은 문제를 경험하셨는데 해결하신 분 계신가요?ㅜㅜ