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Kernel thread가 원자적 보장이 더 쉽게 된다는 건 어떤 근거인가요?
잘 이해가 안 가네요?

그리고, 워드 단위(예를 들어 32bit)의 크기를 다룬다고 해서 원자성이 보장된다는 것은 항상 옳은 것은 아닙니다.
임의의 주소(4의 배수가 아닌)로의 접근이 가능한 플랫폼의 경우(머신 자체에서 지원 or OS의 트랩 기능을 이용한 지원)는 실제로는 32bit의 자료형일지라도 워드의 경계에 걸쳐 있을 가능성이 있죠..
그런 경우라면 실제로 메모리 읽기는 두 번이 필요합니다. 즉, 그 사이에 쓰레드가 선점되고 다른 쓰레드가 동일 메모리 주소를 접근할 가능성이 있죠..
물론 위에서 제시하신 경우보다 확률은 더더욱 희박합니다.

간단하게 수정하면 될것 같은데요...
음... 하루 정도 돌려보기는 힘들것 같네요.. -_-;;;

int main(void) 
{ 
pthread_t s_Thread; 
unsigned long long s_qword = 0xffffffffllu; 

/* ----- 추가 ------ */
int policy = SCHED_RR; 
struct sched_param param;

    param.sched_priority = sched_get_priority_min( policy );
    if( sched_setscheduler( getpid(), policy, & param  ) )
    {
        perror("schedure error");
        return 0;
    }
/* ---  추가 끝 ---- */
pthread_create(&s_Thread, NULL, ThreadPrint, &s_qword); 
pthread_detach(s_Thread); 
do 
{ 
  if(s_qword == 0xffffffff00000000llu)s_qword = 0xffffffffllu; 
  else s_qword = 0xffffffff00000000llu; 
/* --- 수정 --- */
  usleep( 10000 );   // usleep(0); 
/* 10000 이하로 주면 다운됩니다. 주의하시길 */ 
  // fprintf(stdout, "0x%016llx\n", s_qword); 
}while(1); 
return(0); 
}