cannot execute binary file 에러 질문이요...

윈도우 환경에서만 코딩을 하다가 리눅스를 하려니 막히는 게 많네요.
현재 제 상황은 이렇습니다.
cygwin을 설치했구요.
qtopia sdk를 설치하고 qtopia SDK에 속해있는 qmake을 실행시켜라하니
cannot execute binary file이라는 에러 메시지가 뜨네요.
PATH는 제대로 걸어 놓은 것 같구요. 그 경로에 파일도 존재합니다.
(만약 아니라면 그런 파일이나 디렉토리는 없다고 나왔겠죠?)
혹시나 해서 해당 파일만 chmod 777로 바꿔도 봤는데 안돼네요.
왜 실행할 수 없다고 나오는 걸까요?

이런 상황의 에러 메시지가 나오는 경우가 어떤 게 있을지요?
검색을 해보니 권한의 문제라고도 하는 것 같은데
ls -l로 보면 owner가 제 아이디로 나타나는 데요.

이런 일을 미리 겪으신 분들이 많으실 거라 생각됩니다.

고견을 부탁드립니다.