우분투 6.06을 새 하드로 옮기고 싶은데요

가능하다면 30기가 하드디스크를 마운트해서 쓰는 게 좋을 것 같습니다.
제가 써보기에는 사용자 데이터 외에는 10기가를 넘지 않는 것 같습니다. 그래서 전 / 파티션으로 10기가 잡고 /home 에 대용량 파티션을 마운트해서 씁니다.

복사를 원하신다면...
저는 파일시스템을 XFS로 바꿔보려고 복사해봤습니다. 그 과정을 한번 적어 볼게요. 잘못될 경우 책임을 질 수 없음을 말씀드립니다. / 파티션 하나만 있다고 가정합니다.
먼저 sudo -s 로 root 권한으로 변경.

fdisk나 cfdisk나 gparted 등으로 30기가 하드디스크에 / 파티션과 swap 파티션을 현재 13기가 하드디스크와 같은 순서로 만들어 줍니다. /etc/fstab이나 grub 같은 거 바꾸는 것을 피하기 위해... 혹시 /etc/fstab이 LABEL로 파티션을 구분하면 LABEL도 똑같이 설정해 주거나 /etc/fstab을 변경해야 합니다. LABEL이 아닌 /dev/hda1 와 같은 것으로 구분하게...
그리고 리부팅해서 그 파티션들을 현재 디스크와 같은 파일시스템 종류로 만들어(포맷) 줍니다. mkfs.ext3, mkswap 등을 사용해서.

그 다음에 30기가 하드디스크의 / 파티션을 /mnt 에 마운트합니다. 그 다음에 / 아래에 있는 것을 모두 복사... 오랜 기다림 필요.
# cd /
# tar cf . | ( cd /mnt ; tar xpf - )

그 다음에 grub을 새 하드디스크 MBR 설치하기 위해서...
30기가 하드디스크가 장치명이 /dev/hdb 임을 가정합니다.
# chroot /mnt /bin/bash
# grub-install /dev/hdb
솔직히 이 과정이 잘 될지 모르겠습니다. 저는 grub-install이 잘 안 돼서(grub과 xfs 간에 약간 문제가 있는 것 같은 것 같습니다) 삽질을 좀 했습니다.
이게 에러없이 잘 되었다면 컴퓨터를 끄고 30기가를 마스터로 장착하고 13기가짜리를 떼어 냅니다.

그런 다음 부팅. 안 되면 원래대로 다시 장착... ^^