여러 OS를 사용할 경우, Disk 파티셔닝을 어찌 하시나요?

한동안 *nix 계열에 손대지 않고 있다가, 오랜만에 다시 붙들어보려고 합니다.
막상 OS를 설치하려니 고민이 생겼습니다.
사무실 컴퓨터와 집의 컴퓨터, 각각의 컴퓨터에는 지금 Windows가 깔려있지만 멀티부팅방식으로 Linux, FreeBSD 를 설치할 생각입니다.
(가끔씩은 양쪽 컴퓨터를 왔다갔다 하면서 휴대용 (USB) HDD를 장착하고 쓴답니다.
그러니 사무실 컴퓨터는 FreeBSD, 집 컴퓨터는 Windows 뭐 이런 식으로 셋팅이 될 수도 있습니다.)

실제로 OS와 각종 프로그램이 차지하는 공간은 10G 정도면 충분하지요.
남는 HDD 공간은 당연히 문서라든가 작업하는 파일들, ebook이나 mp3, 동영상 등 각종 데이터가 들어갈 겁니다.
윈도우를 주로 쓰시는 분이라면 아마 데이터는 모두 NTFS 파티션에 들어있을 것이고, *nix 체제는 실험용(?)으로 쓰실 꺼구요. 거꾸로 *nix를 주로 쓰시는 분이라면 주활동무대인 UFS 또는 각종 저널링FS에다 데이터를 보관하시겠죠.
그런데, 양쪽 OS를 모두 자주 사용한다면, 이 데이터 파티션을 어떻게 설정하는게 좋을까요?
다들 FAT32로 해놓고 쓰시나요?
FAT32 말고 ext2도 가능한걸로 아는데...
(관련글 http://bbs.kldp.org/viewtopic.php?t=46226 을 따라가면 여러가지 방법이 있는 것도 같습니다.)
모두 써본 적이 없는 거라서 불안하군요.
가장 좋은 대안이 뭘까요?

(설마 rsync로 여러 PC, 여러 파티션에 똑같은 데이터를 유지하는건 아니겠죠? ^^;;)