0x01과 0x0001과 0x00000001의 차이는 무엇일까요

모두 int형이고 1을 뜻하므로 차이가 없습니다.
그리고 비트 연산을 할 때는 반드시 unsigned 형으로 하시기를 권합니다.
음수에 대해 >> 연산을 하면 왼쪽에 채워지는 숫자가 0이 될지 1이 될지
정해지지 않기 때문입니다. 따라서 0x01u 등으로 쓰는 것이 좋지요.