phpwiki에서 mysql을 version up 할때.. 데이터및 user데이터를

같은 4.x 대라 그냥 복사 해 주는것으로 가능할 듯 합니다.

확실하게 mysqldump 를 하는 것이 좋을 듯 하구요.

mysql DB 의 user table , db table 과
phpwiki DB 를 옮기시면 될 것입니다.

mysqldump mysql user > user.sql
mysqldump mysql db > db.sql

아니면 mysql DB 전체..
mysqldump mysql > mysql.sql

등이면 확실할 것입니다.

복구 는
mysql mysql < user.sql 으로.

phpwiki 의 데이터는 위와 마찬가지로

mysqldump DB이름 table이름 형식..

소스설치를 했는지 모르겠지만, 소스설치라면 설치 디렉토리 var/ 또는 data/ 디렉토리 에 데이터가 위치할 것입니다.