c&c++ 프로젝트에서의 디렉토리 구조에서 헤더파일 위치에 대한 의견을 부탁드립니다.

c&c++에서 gtkmm으로 간단한 프로그램을 작성중입니다.
c&c++ 왕초보입니다.
그래도 개인이 하는 프로젝트이지만
여러 팀들이 운영할 성격을 가지고 진행하고자 노력합니다.
그런데 혼동스러운것이 있네요.
출처를 알수없지만 .cpp 있는곳에 .h를 두라고 해서 지금까지 그렇게 작업을 했습니다.
그런데 log4cxx 소스 구조를 봐도 그렇고
Netbeans에서도 헤더파일을 따로 빼놓은것을 봐도 그렇고
소스 .cpp와는 다른 곳에 헤더파일을 모아두는것 같습니다.
출처를 알수없는 곳에서는 왜 헤더파일과 소스를 같은 위치에 두라고 했는지,
log4cxx등에서는 왜 헤더파일을 소스와 분리했을까?
의문이 들어서 이렇게 여기에 의견을 듣고자 글을 적습니다.