CMake 과 MEX (Matlab) 을 사용한 ITK 빌드

우분투 상에서 CMake (http://www.cmake.org/) 과 MEX (Matlab)컴파일러를 이용해서 ITK (http://www.itk.org/)를 빌드하려고 하는데 다음과 같은 문제가 발생하네요. 헤더를 찾지 못하는거 같은데 MEX 컴파일러 옵션을 아무리 뒤져봐도 그에대한 설명이 안나와 있더군요.

참고로 말씀드리면 MEX 컴파일러는 Matlab에서 제공한 가상의 컴파일러 개념입니다. 설치된 OS 따라 다른 컴파일러를 이용해서 Matlab 상에서 function을 쉽게 불러와서 사용할 수 있게 도와주는 일종의 Gateway 개념이라고 보시면 될 것 같습니다. 우분투상에서는 gcc 와 g++를 사용하구요.

다음 페이지의 중간쯤에 있는 예제를 참고했습니다. (http://www.cmake.org/Wiki/CMake:MatlabMex)
간단한 예제라 그런지 몰라도 이 페이지에서 제공한 예제는 문제없이 돌아갑니다.
사용한 CMake은 패치된 버젼입니다. 패치는 다음 페이지에서 찾을 수 있습니다. (http://public.kitware.com/Bug/view.php?id=9240)

제 터미널 상에 나타난 상황입니다. 조언이 간절이 필요한 상황입니다.

CC=/usr/local/matlab/bin/mex CXX=/usr/local/matlab/bin/mex ../../cmake-2.6.4-patch/bin/cmake ../InsightToolkit-3.20.0
-- The C compiler identification is mex
-- The CXX compiler identification is mex
-- Looking for sys/types.h
-- Looking for sys/types.h - not found
-- Looking for stdint.h
-- Looking for stdint.h - not found
-- Looking for stddef.h
-- Looking for stddef.h - not found
-- Check size of int
-- Check size of int - failed
CMake Error: An attempt was made to access a variable: CMAKE_SIZEOF_INT that has not been defined. Some variables were always defined by CMake in versions prior to 1.6. To fix this you might need to set the cache value of CMAKE_BACKWARDS_COMPATIBILITY to 1.4 or less. If you are writing a CMakeList file, (or have already set CMAKE_BACKWARDS_COMPATABILITY to 1.4 or less) then you probably need to include a CMake module to test for the feature this variable defines.
-- Check size of long
-- Check size of long - failed
-- Check size of void*
-- Check size of void* - failed
-- Check size of char
-- Check size of char - failed
-- Check size of short
-- Check size of short - failed
-- Check size of float
-- Check size of float - failed
-- Check size of double
-- Check size of double - failed
-- Looking for limits.h
-- Looking for limits.h - not found
-- Looking for unistd.h
-- Looking for unistd.h - not found
-- Looking for pthread.h
-- Looking for pthread.h - not found
-- Looking for include files CMAKE_HAVE_SYS_PRCTL_H
-- Looking for include files CMAKE_HAVE_SYS_PRCTL_H - not found.
-- Check if the system is big endian
-- Searching 16 bit integer
-- Check size of unsigned short
-- Check size of unsigned short - failed
-- Check size of unsigned int
-- Check size of unsigned int - failed
-- Check size of unsigned long
-- Check size of unsigned long - failed
CMake Error at /home/yochju/cmake-2.6.4-patch/Modules/TestBigEndian.cmake:31 (MESSAGE):
no suitable type found
Call Stack (most recent call first):
/home/yochju/cmake-2.6.4-patch/Modules/CMakeBackwardCompatibilityC.cmake:31 (TEST_BIG_ENDIAN)
CMakeLists.txt:63 (INCLUDE)

-- Configuring incomplete, errors occurred!