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R cel 파일 또는 .csv파일의 affy ID 사이의 pearson correlation coefficient 구하는 방법좀 알고싶습니다

windyguy81의 이미지
글쓴이: windyguy81 / 작성시간: 목, 2010/07/29 - 4:34오후

제가 cel 파일을 읽은 후 RMA normalization 을 하였습니다..
그런후 affy id 사이의 PCC 값을 구하고 싶습니다...
PCC 값이 잘 나오지 않더라고요 ㅠ
결과)
affy id-1 affy id-2 1.4

이런식으로 구하고 싶은데아시는분 알려주셔요 ㅠ 참 결과 옆에 각 affy id 사이의 p-value또한 알수 있을까요 ...

참 csv 파일에 가지고 있는 normalization 값을 읽은후
예) sample1 sample2 sample3
affyID1 1.2 2.4 1.2
affyID2 2.3 2.1 2

이런식의 데이터를 affyID로 PCC 값과 P-value 값을 구할수 있을까요??
제가 하면 sample 값에 대한 PCC 값만 뜨거든요 ㅠ
아시는분 알려주시면 감사하겠습니다

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